Kubanin tulvien todelliset syyt, jotka vaativat useita satoja ihmishenkiä ja tuhosivat tuhansia koteja, eivät ole tiedossa. Aiheesta on kuitenkin useita teorioita, sekä virallisia että "suosittuja".
Yöllä 7. heinäkuuta Kubanissa alkoi tulva, joka tuhosi talot Gelendzhikissä, Novorossiyskissa, Krymskissä ja useissa kylissä. Tuolloin, kun ensimmäinen hätäministeriön varoitus ilmestyi, eloonjääneet istuivat jo talojen katolla ja vanhukset, lapset ja vammaiset, jotka eivät pystyneet paeta, kuolivat. Juuri tämän tosiasian avulla voimme väittää, että osittain sadat ihmiset olivat syyllisiä hätätilanneministeriön edustajiin, jotka eivät varoittaneet ajoissa katastrofista eikä järjestäneet evakuointia.
Yksi tulvien syistä on liiallinen sademäärä. Virallisten lausuntojen mukaan viiden kuukauden sademäärä osui Kubaniin päivässä, aiheuttaen jokien ylivuodon ja tulvat kaupungit. Krymsk vaurioitui erityisen pahasti, sillä vedenpinta tietyissä paikoissa ylitti kolmen metrin rajan. Virtaus oli niin voimakas, että autot ja jopa kuorma-autot kääntyivät veden paineen alaisena.
Epävirallinen versio, jonka virkamiehet hylkää, on Neberdzhaevsky-säiliön läpimurto tai veden organisoitu tai automaattinen tyhjentäminen siitä. Erityisesti tutkintakomitean edustajat pystyivät toteamaan, että vesi säiliöstä valui todella, kun rankkasade alkoi, mutta ei voida tarkkaan todeta, että tämä johti tragediaan. On myös huhuja, että viemäri ei ollut automaattista, vaan erityisesti järjestettyä, koska virkamiehillä oli valinta: tulvata Krymsk tai anna veden kulkea Kubanin muiden osien läpi, mukaan lukien alue, jolla presidentti Putinin dacha sijaitsee. Tätä versiota ei vahvistettu eikä kiistetty.
Ja lopuksi, virallinen teoria sanoo, että Kubanin tulva johtui tulvien vaarallisten alueiden kehityksestä. Tragedian toistumisen estämiseksi Gosprirodnadzoria, Rosvodresursamia ja Roshydrometia kehotettiin toteuttamaan kaikki tarvittavat toimenpiteet. Hydrologiset asemat päätettiin palauttaa mahdollisimman pian, varmistaa Krymskin ja Novorossiyskin sääasemien paras toiminta ja ryhtyä toimiin uusien luonnonkatastrofien estämiseksi.
